Program Studi Doktor (S3) Bimbingan dan Konseling Universitas Negeri Surabaya (Unesa) dipimpin oleh Prof. Dr. Najlatun Naqiyah, M.Pd. selaku Koordinator Program Studi. Program ini memiliki visi untuk menjadi program studi unggulan bertaraf internasional serta menjadi rujukan dalam pengembangan layanan bimbingan dan konseling spiritual dan bagi anak berkebutuhan khusus (ABK) di Indonesia pada tahun 2045. Untuk mewujudkan visi tersebut, program studi ini mengusung misi: (1) mengembangkan penelitian bertaraf internasional yang mampu menemukan, mengaplikasikan, dan mempublikasikan ilmu bimbingan dan konseling di berbagai setting, dengan keunggulan pada bidang BK religius dan BK untuk kebutuhan khusus; (2) menghasilkan kegiatan pengabdian kepada masyarakat yang berdampak nyata dalam peningkatan kualitas layanan bimbingan dan konseling serta mendukung kemajuan pendidikan secara menyeluruh; dan (3) menjalin kerja sama internasional guna memperkuat pendidikan bimbingan dan konseling yang inovatif, adaptif, dan inklusif.

Program studi ini didukung oleh enam Dosen Tetap Program Studi (DTPS) dan lima dosen pengampu mata kuliah. Kurikulum dirancang secara komprehensif dan mendalam, dengan total beban studi sebesar 65 SKS, guna membekali lulusan dengan kompetensi akademik dan profesional tingkat lanjut di bidang bimbingan dan konseling.